Prácticas de seguimiento digital de la biodiversidad

La jornada y conferencia ARISE de marzo de 2023 se celebró en el Centro de Biodiversidad Naturalis de Leiden ( Países Bajos ). Además de un centro de investigación, Naturalis es también un museo de la biodiversidad. Tras debatir sobre el seguimiento participativo de la biodiversidad y la identificación automatizada de especies con ObsIdentify, Michelle puso a prueba los límites de este software y experimentó el proceso de validación interna.

_

_

Entre el 18 y el 21 de mayo organizamos un BioBlitz en Ecodorp Boekel para cartografiar las especies locales y experimentar el uso de aplicaciones automatizadas de identificación de especies. El BioBlitz fue organizado por Michelle y aproximadamente 11 participantes se unieron para mapear especies de plantas, animales y hongos a través de la aplicación móvil ObsIdentify. (Se unieron más personas cuyos datos no se recogieron, incluidos los <18 años de edad, así como las personas que se unieron pero no registraron sus datos en línea a través de la aplicación). Durante este fin de semana prolongado con condiciones meteorológicas agradables, subimos colectivamente 310 observaciones que incluían 157 especies diferentes.

Lo que salta inmediatamente a la vista al observar estos datos es el gran interés de los habitantes de Ecodorp por observar e identificar especies vegetales. Contrariamente a las estadísticas de los usuarios de Waarnemingen.nl, que observan sobre todo aves, este BioBlitz estaba mucho más orientado a las plantas. Esto no sólo refleja el interés de los habitantes y el tiempo que dedican al cultivo de sus propios alimentos, sino que también nos dimos cuenta de que las plantas eran mucho más fáciles de documentar que los insectos en movimiento o los hongos casi invisibles.

Al entrevistar a los participantes mientras localizaban especies y utilizaban la aplicación móvil se descubrieron muchas historias y observaciones interesantes. Un participante se dedicaba a entrenar la vista y la actividad de buscar insectos le pareció muy adecuada para entrenar el movimiento ocular y cambiar de perspectiva. Otro participante fue desplazado forzosamente de Yemen y, mientras observaba especies a nivel local, hablamos de los tipos de plantas que hay en Yemen, sus nombres y las relaciones de los miembros de su familia con las plantas autóctonas.

A una de las participantes le preocupaba el valor científico de cartografiar las especies. Ella es una voluntaria con experiencia en el seguimiento de la biodiversidad y compartió los principios del seguimiento sistemático para ayudar a dividir a la gente de la zona. Algunos padres se unieron al BioBlitz con sus hijos como actividad educativa. Entablaron conversaciones y expresaron su entusiasmo por las distintas especies que encontraron. Otros participantes estaban más interesados en cartografiar los pequeños jardines que hay frente a sus casas para conocer la biodiversidad que puede observarse cerca de ellos.

Varios participantes tuvieron dificultades para conectar sus teléfonos móviles a la aplicación o experimentaron otras limitaciones, como alcanzar los límites de datos móviles en sus teléfonos. Otro tema muy debatido fue la precisión de la identificación automática de especies. Los participantes descubrieron que la aplicación sólo registraba automáticamente la observación una vez que revelaba una precisión superior al 90% para cada observación. Esto llevó a los participantes a descartar todas las observaciones "menos acertadas" y a borrar estas imágenes. Los participantes debatieron estrategias para fotografiar "correctamente" las plantas y observaron cómo ciertos grupos de plantas (como las gramíneas) eran mucho más difíciles de identificar.

Un comentario recurrente durante el BioBlitz fue el entusiasmo de los participantes por el uso de la aplicación móvil. "Es realmente adictivo", dijo una participante. Explicó que trabajaba en el mantenimiento del huerto durante el día, pero que se sentía atraída continuamente por las imágenes y el registro de nuevas observaciones a medida que diferentes especies llamaban su atención. Esta forma de moverse por el espacio le recordaba a Michelle la exploración de videojuegos de mundo abierto diseñados para despertar la curiosidad mediante la colocación estratégica de elementos de juego.

Ésta es sólo una pequeña muestra de reflexiones e imágenes del BioBlitz. Revela cómo la actividad de cartografiar la biodiversidad a escala local está estrechamente relacionada con los intereses y experiencias personales de la gente. Más que una colección de observaciones que se asemeje a la exactitud científica, la actividad de cartografiar proporciona una reflexión más detallada sobre cómo los participantes se sienten atraídos por las distintas especies. Además, los resultados no reflejan la presencia de especies, sino que demuestran principalmente qué especies son aptas para la identificación automática con el software de reconocimiento de imágenes de la aplicación.

En las semanas siguientes al BioBlitz, más habitantes de Ecodorp se unieron como usuarios registrados de ObsIdentify y compartieron experiencias y perspectivas. La gente utilizó la aplicación para hacerse preguntas sobre qué plantas locales son comestibles, y disfrutaron haciéndose preguntas a sí mismos y a los demás sobre la identificación de especies. Los habitantes siguen añadiendo observaciones de especies a la plataforma y es posible que se añadan más reflexiones a medida que se desarrolle el trabajo de campo .

Durante el taller ARISE-day 2023, yo (Michelle) tuve la oportunidad de asistir a un taller de gestión de datos organizado por el nodo holandés de GBIF, donde aprendí más sobre los principios de estandarización de datos para datos de biodiversidad. Aquí trabajamos con el conjunto de datos de árboles monumentales holandeses para explorar cómo crear una base de datos que pueda cargarse en GBIF. Lo que me llamó la atención durante este taller fueron las diversas formas en que los datos de árboles individuales que tienen valor histórico, cultural o social se transforman en una base de datos que sólo incluye nombres de especies, coordenadas GPS, años de las plantas, imágenes y el nombre del fotógrafo. En otras palabras, el proceso de estandarización trabaja para crear categorías singulares que sirvan para todas las ocurrencias de GBIF, eliminando así aquellos tipos de datos que hacen que estas ocurrencias sean únicas.

Además, mientras que el protocolo Darwin Core es de código abierto y se describe como "flexible", las prácticas de normalización de GBIF se alinean con un tipo más occidental de gestión de datos científicos que, por ejemplo, da prioridad a los nombres de las especies, las marcas de tiempo, la ubicación y los datos de propiedad. Cuando este tipo de normalización de datos se implanta a escala mundial, se corre el riesgo de eliminar las posibilidades de que otros tipos de datos se incluyan en marcos globales. Uno de los organizadores señaló que, si bien los principios de datos FAIR son importantes para los datos holandeses de GBIF, los principios CARE no son realmente relevantes porque "son para los pueblos indígenas y la soberanía de los datos ". Estas interpretaciones demuestran cómo las personas implicadas en la gestión de datos sobre biodiversidad en el Norte Global pueden considerar las diferentes prácticas de datos como iniciativas separadas en todo el mundo con protocolos éticos distintos, mientras que al mismo tiempo GBIF trabaja para establecer estándares globales. Estas experiencias materializan las necesidades contrapuestas tanto de estandarización de datos como de formas únicas de entender la biodiversidad.

Con el creciente uso de teléfonos móviles inteligentes, las aplicaciones que ayudan a vigilar la biodiversidad están muy extendidas y cuentan con millones de usuarios (sobre todo en el Norte Global). Estas aplicaciones se centran específicamente en el reconocimiento de especies de plantas, animales y hongos a partir de grabaciones de imagen o sonido. Antes, los taxónomos o los científicos ciudadanos tenían que evaluar manualmente todos estos datos para identificar las especies. Ahora, la mayoría de las aplicaciones más utilizadas incorporan funciones automatizadas para identificar especies a partir de técnicas de reconocimiento de imágenes o sonidos.

Ejemplos de aplicaciones con grandes bases de usuarios son iNaturalist, eBird,Merlin (las tres desarrolladas en Estados Unidos), la francesa Pl@ntNet, la holandesa ObsIdentify y nodos nacionales de iNaturalist como el portal británico iRecord. Cada una de estas aplicaciones recoge miles de observaciones al día. Dependiendo de la infraestructura de la aplicación, además de los datos de identificación de las especies, cada observación contiene metadatos sobre la hora, la ubicación y estadísticas del usuario. Algunas aplicaciones, como iNaturalist, se basan principalmente en la observación automatizada y la ciencia ciudadana, mientras que otras, como ObsIdentify, seleccionan observaciones específicas para que sean evaluadas por "validadores" o "expertos" voluntarios. Algunas de estas tecnologías también pueden conectarse directamente a equipos como prismáticos o cámaras para registrar directamente imágenes más detalladas y de alta resolución.

En lugar de desarrollar nuevos conjuntos de datos taxonómicos, estas aplicaciones suelen estar conectadas a bases de datos digitales de especies nacionales e internacionales de mayor envergadura. eBird, por ejemplo, trabaja con el "Working Group Avian Checklists" para crear una taxonomía global única para las especies aviares. ObsIdentify es una aplicación de Observations.org, que está conectada con Naturalis, un instituto nacional holandés de biodiversidad. La mayoría de los datos (validados) de estas aplicaciones, incluido iNaturalist, se indexan finalmente como datos abiertos en GBIF, el Global Biodiversity Information Facility.

GBIF contiene cientos de millones de registros de presencia de especies procedentes de fuentes como colecciones de museos, ADN electrónico, bases de datos de investigación y datos de ciudadanos. La iniciativa intergubernamental se puso en marcha en 1999, tiene una secretaría en Copenhague, cuenta con la participación de 42 países con derecho a voto y está financiada por los gobiernos. Uno de sus objetivos es crear protocolos de estándares de datos, concretamente con el uso del protocolo Darwin Core.