O plano de biodiversidade do Ecodorp Boekel inclui 10 espécies diferentes: o pipistrelle comum, o morcego serotino, o abelhão de cauda vermelha, a abelha pedreira vermelha, a borboleta vírgula, a borboleta pavão, o pardal doméstico, o estorninho, o grilo verde grande e o azulão. O sítio tem por objetivo atrair um determinado número de espécies por ano, até 2033.