Le plan de biodiversité d'Ecodorp Boekel comprend 10 espèces différentes : la pipistrelle commune, la chauve-souris sérotine, le bourdon à queue rouge, l'abeille maçonne rouge, le papillon virgule, le papillon paon, le moineau domestique, l'étourneau sansonnet, le grillon vert et le bleuet azuré. Le site a pour objectif d'attirer un nombre déterminé d'espèces pour chaque année d'ici à 2033.